Острые кишечные инфекции (Shigella, ЕIEC, Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Astrovirus, Norovirus G2), качественное определение ДНК методом ПЦР

Острые кишечные инфекции - группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи.
Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты).
Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.

Shigella species и Esherichia coli (EIEC) – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде.  Астровирусы в сравнении с ротавирусами  и норовирусами имеют несколько меньшую распространенность, составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с проявлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста. 

Метод ПЦР позволяет выявить в биологическом материале (в кале) фрагменты генетического материала (ДНК) возбудителя инфекции. ПЦР характеризуется очень высокой чувствительностью (93-95%), что является преимуществом при анализе кала.
 

кал

Отмена или прием лекарственных препаратов обсуждается с врачом в каждом индивидуальном случае.
При контроле лабораторных показателей в динамике рекомендуется проводить лабораторные исследования в одинаковых условиях: сдавать кал в одинаковое время суток, в одной лаборатории и т.п.
Про прием лекарственных препаратов необходимо обязательно сообщить сотрудникам в отделении.
Данное исследование оформляется только из приносного биоматериала.

Правила взятия биологического материала:

• Для исследования собирают свежевыделенный кал. Перед сбором необходимо помочиться (для исключения возможности попадания мочи в фекальные массы).
• При сборе биоматериала необходимо избегать контаминации биологического материала посторонней микрофлорой (тщательно мыть руки до взятия, использовать только стерильные расходные материалы и т. д.).
• Кал собирается в стерильный одноразовый контейнер специальной ложечкой в количестве не менее 10-15 г, не более 1/3 объема контейнера (если при сборе материала используют судно, то его предварительно необходимо обработать дез. средством, а после ополоснуть кипятком, чтобы удалить следы дез. стредства).
• На исследование берется средняя порция каловых масс. Первая порция, или каловая пробка, на исследование не набирается.

Особенности взятия кала у младенцев:

• У грудничков пpoбы фекалия собирают с памперса, не касаясь его поверхности. Heбольшую часть 1.0-3.0 г (1.0-3.0 мл) собирают с 7- 10 разных мест ложечкой контейнера или другим стерильным предметом.
• Разрешено использовать микроклизму с кипяченной охлажденной водой (100 мл).
• Запрещено использовать ректальные свечи. 

Перед взятием материала рекомендовано:

За 1-3 дня до взятия материала исключить из рациона приём продуктов, усиливающих процессы брожения в кишечнике и молочнокислые продукты, алкоголь.

Не следует сдавать:

• Кал полученный после клизмы, а также после приема бария (при рентгенологическом обследовании).
• Женщинам не рекомендуется сдавать анализ кала во время менструации.  

Сбор материала осуществляется до начала антибактериального и антимикробного лечения (общего и местного значения), либо через 2-3 недели после отмены этих препаратов.

За 3-4 дня до исследования отменить прием:

• слабительных препаратов, касторового, вазелинового масел;
• препаратов, которые усиливают перистальтику кишечника или изменяют цвет кaла;
• прекратить введение ректальных свечей. 

Транспортный контейнер
Cтерильный пластиковый стаканчик с ложкой и крышкой – необходимо указать ФИО пациента, а также дату и время сбора материала.

Хранение биологического материала

• Для Одессы - материал доставляется в любое отделение лаборатории Смартлаб в течение 2-х часов с момента сбора анализа. При невозможности быстрой доставки в отделение лаборатории, емкость с калом можно хранить в холодильнике, при температуре +2 …+8 °С не более 10 - 12 часов.
• Для других городов - необходимо доставить биоматериал в любое отделение лаборатории Смартлаб в течение 2-х часов с момента сбора анализа.
  

Недопустимо направлять кал на исследование в спичечных или картонных коробках, так как при этом меняются форма и консистенция кала, и искажаются результаты анализа. 

АНАЛИЗАТОР:

РЕФЕРЕНСЫ:

ПОНИЖЕНИЕ УРОВНЯ:

отсутствие возбудителя ОКИ в биоматериале: этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus G 2, Astrovirus). 

ПОВЫШЕНИЕ УРОВНЯ:

наличие возбудителя ОКИ в биоматериале: этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus G 2, Astrovirus). 

показания для назначения:

• установление этиологического фактора острой кишечной инфекции;
• дифференциальная диагностика причин острого гастроэнтероколита.